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Doctorado en Ciencias Quimica
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Molecular dynamics
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Métodos tipo Car-Parrinello en el estudio de biomoléculas y superficies
Beschreibung: El presente rabajo de tsis secentra en laimplementación y aplicación de métodos tipo Car-Parrinello en el estudio de propiedades fisicoquímicas de sistemas complejos, particularmente sistemas que involucran cientos de átomos en su modelado, explotando de esta forma el supercómputo en paralelo y la eficiencia numérica de tal metodología para calcular... Fach: Functional analysis, Análisis funcional, Dinámica molecular, and Molecular dynamics Schöpfer: Ireta Moreno, Joel Mitwirkender: Galván Espinosa, Marcelo Enrique, Ramírez Solís, Alejandro, Santamaría Ortiz, Rubén, Cedillo Ortiz, José Andrés, and Cruz Jiménez, Salvador Antonio Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 1999 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.f4752h288 -
Desarrollo de campos de fuerza para fluidos polares usando agua explícita
Beschreibung: Los campos de fuerza más utilizados en simulaciones de dinámica molecular han sido parametrizados para reproducir la densidad del líquido y la entalpía de vaporización de componentes puros, y en versiones más recientes se ha introducido la energía libre de solvatación como propiedad objetivo. Como consecuencia de este proceso de... Fach: Fluid mechanics, Dinámica molecular, Mecácnica de fluidos, and Molecular dynamics Schöpfer: García Melgarejo, Valeria Mitwirkender: Quintana Hinojosa, Jacqueline, Benavides Obregón, Ana Laura, Chapela Castañares, Gustavo Adolfo, Alejandre Ramírez, José Reyes, and González Melchor, Minerva Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2023 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.9g54xj24w -
Desarrollo de un campo de fuerzas para sistemas que se autoensamblan con puentes de hidrógeno
Beschreibung: Se sabe empíricamente que el agua y el aceite no se mezclan, puesto que se muestra una separación de dos fases líquidas de distinta densidad. La miscibilidad de una sustancia en otra, depende de la afinidad química que exista entre ambas sustancias. La miscibilidad no debe confundirse con la solubilidad:... Fach: Teoría de campos (Física), Molecular dynamics, Field theory (Physics), Electrostática, Electrostatics, and Dinámica molecular Schöpfer: Pérez de la Luz, Alexander Mitwirkender: Alejandre Ramírez, José Reyes Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2018 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.dj52w490s -
Estudio molecular de mezclas binarias con interacciones esféricas y no-esféricas
Beschreibung: En este trabajo se presenta una extensa revisión y nuevos resultados obtenidos en el campo de sistemas binarios con interacciones moleculares esféricos, tipo LennardJones y no-esféricos (anisótropos) tipo Gay-Berne. Este estudio se realizó´ utilizando la metrología de simulaciones moleculares, principalmente Dinámica Molecular. Con el objetivo de corroborar que los estados... Fach: Mixtures, Liquids, Dinámica molecular, Mezclas, Thermodynamics, Líquidos, Molecular dynamics, and Termodinámica Schöpfer: Moreno Razo, José Antonio Mitwirkender: Cruz Jiménez, Salvador Antonio, Quintana Hinojosa, Jaqueline, Velasco Belmont, Rosa María, Rojas González, Fernando, Hernández Contreras, Martín, and Díaz Herrera, Jesús Enrique Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2007 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.cf95jb630 -
Análisis del acoplamiento o interacción de macrociclos tetrapirrólicos y albumina de suero bovino
Fach: Moléculas, Pyrroles, Molecules, Pirroles, Dinámica molecular, and Molecular dynamics Schöpfer: Vicente Escobar, Jonathan Osiris Mitwirkender: García Sánchez, Miguel Ángel Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2022 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial-SinDerivadas 4.0 Internacional (CC BY-NC-ND 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.6m311p537 -
Interacciones moleculares y propiedades interfaciales de hidrocarburos y agua
Fach: Chemistry, Water, Hydrocarbons, Hidrocarburos, Química, Dinámica molecular, Agua, and Molecular dynamics Schöpfer: Mendoza Ambrosio, Francisco Noé Mitwirkender: Galván Espinosa, Marcelo Enrique, Benavides Obregón, Ana Laura, Chapela Castañares, Gustavo Adolfo, Díaz Herrera, Jesús Enrique, and Saint Martin Posada, Humberto Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2010 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.t722h902s -
Desarrollo de potenciales de interacción de solventes orgánicos basados en la constante dieléctrica
Beschreibung: La propuesta principal del presente trabajo doctoral es validar una metodología para desarrollar nuevos parámetros en los potenciales de interacción mediante simulaciones de Dinámica Molecular (DM), teniendo a la constante dieléctrica como propiedad a reproducir. Los sistemas moleculares elegidos en este trabajo fueron la acetamida, un solvente altamente polar y... Fach: Chemistry, Organic, Química orgánica, Funcionales de densidad, Organic solvents, Dinámica molecular, Solventes orgánicos, Density functionals, and Molecular dynamics Schöpfer: Aguilar Pineda, Jorge Alberto Mitwirkender: Ortega Blake, Iván, Galván Espinosa, Marcelo Enrique, Quintana Hinojosa, Jacqueline, Chapela Castañares, Gustavo Adolfo, Ireta Moreno, Joel, and Alejandre Ramírez, José Reyes Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2017 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.2v23vt62p -
Campos de fuerza para el agua y la dinámica de nucleación de iones en soluciones acuosas
Beschreibung: Esta tesis es concerniente al estudio, por medio de dinámica molecular, del desarrollo de nuevos campos de fuerza del agua así como de la implementación de un método computacional para obtener la velocidad de nucleación de iones en soluciones acuosas. Para el agua, un punto importante en este trabajo es... Fach: Interacciones ión-agua, Chemistry, Water chemistry, Nucleation, Dinámica molecular, Química del agua, Química, Molecular dynamics, and Nucleación Schöpfer: Fuentes Azcatl, Raúl Mitwirkender: Domínguez Castro, Héctor, Saint-Martin, Humberto, Galván Espinosa, Marcelo Enrique, Alejandre Ramírez, José Reyes, and Chapela Castañares, Gustavo Adolfo Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2014 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.jm214p19p -
Parametrización de Cu2+ en un campo de fuerzas y su aplicación a metalopéptidos
Beschreibung: En la búsqueda por generar metodologías que ayuden al estudio de sistemas biológicos que poseen metales de transición con técnicas como la mecánica molecular y la dinámica molecular, se han propuesto diversas estrategias para la parametrización de este tipo de sistemas. Un método de parametrización general y recientemente evaluado es... Fach: Dinámica molecular, Multiscale modeling, Molecular dynamics, and Modelado multiescala Schöpfer: Monjaraz Rodríguez, Alejandra Mitwirkender: Vargas Fosada, Rubicelia, Pérez Hernández, Gerardo, Ireta Moreno, Joel, Domínguez Dueñas, Laura, López Lemus, Jorge, and Zubillaga Luna, Rafael Arturo Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2018 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.rr171x32c -
Estudio computacional de cocristales de interés farmacéutico
Beschreibung: Esta tesis es concerniente al estudio, por medio de dinámica molecular, de sistemas cristalinos que surgen como una alternativa para mejorar las propiedades de fármacos convencionales que presentan una baja solubilidad en agua. La baja solubilidad de algunos fármacos es una limitación para el transporte y la absorción oral repercutiendo... Fach: Cristales moleculares, Intramolecular forces -- Computer simulation, Dinámica molecular, Fuerzas intramoleculares -- Simulación por computadoras, and Molecular dynamics Schöpfer: Salas Sánchez, Frank José Mitwirkender: Zubillaga Luna, Rafael Arturo, Ireta Moreno, Joel, Hernández Cobos, Jorge, Moreno Razo, José Antonio, and Alejandre Ramírez, José Reyes Herausgeber: Universidad Autónoma Metropolitana Posgrado: Doctorado en Ciencias Quimica Sprache: spa Año de publicación: 2017 Rechte: Acceso Abierto Lizenz: Atribucion-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0) Tipo de Recurso: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Identifikator: https://doi.org/10.24275/uami.6h440s46k
